福建省环境保护产业协会成立于1989年12月，原名“福建省环境保护工业协会”，1990年4月改为现名。协会是由从事环境保护产业的企事业单位和与环境保护产业相关的单位以及从事环保科技、管理方面的人员自愿组成的环境保护产业行业性、非营利性社会组织。协会的业务主管部门是福建省经济社团联合会，社团登记管理机关是福建省民政厅。